P05740

PR
Gene name
RPL17A
Protein name
60S ribosomal protein L17-A
Names
L20A, Large ribosomal subunit protein uL22-A, YL17
Species
Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)
KEGG Pathway
sce:YKL180W
EC number
Protein Class

Descriptions

The autoinhibited protein was predicted that may have potential autoinhibitory elements via cis-regPred.

Autoinhibitory domains (AIDs)

78-184 (Predicted disordered autoinhibitory region) PR

Target domain

Relief mechanism

Assay

cis-regPred

Accessory elements

No accessory elements

References

Autoinhibited structure

Activated structure

188 structures for P05740

Entry ID Method Resolution Chain Position Source
2WW9 EM 860 A I 1-184 PDB
2WWA EM 890 A I 1-184 PDB
2WWB EM 648 A I 1-184 PDB
3J6X EM 610 A 57 1-184 PDB
3J6Y EM 610 A 57 1-184 PDB
3J77 EM 620 A 67 1-184 PDB
3J78 EM 630 A 67 1-184 PDB
3JCT EM 308 A P 1-184 PDB
4U3M X-ray 300 A M7/m7 2-184 PDB
4U3N X-ray 320 A M7/m7 2-184 PDB
4U3U X-ray 290 A M7/m7 2-184 PDB
4U4N X-ray 310 A M7/m7 2-184 PDB
4U4O X-ray 360 A M7/m7 2-184 PDB
4U4Q X-ray 300 A M7/m7 2-184 PDB
4U4R X-ray 280 A M7/m7 2-184 PDB
4U4U X-ray 300 A M7/m7 2-184 PDB
4U4Y X-ray 320 A M7/m7 2-184 PDB
4U4Z X-ray 310 A M7/m7 2-184 PDB
4U50 X-ray 320 A M7/m7 2-184 PDB
4U51 X-ray 320 A M7/m7 2-184 PDB
4U52 X-ray 300 A M7/m7 2-184 PDB
4U53 X-ray 330 A M7/m7 2-184 PDB
4U55 X-ray 320 A M7/m7 2-184 PDB
4U56 X-ray 345 A M7/m7 2-184 PDB
4U6F X-ray 310 A M7/m7 2-184 PDB
4V4B EM 1170 A BN 2-184 PDB
4V6I EM 880 A BV 1-170 PDB
4V7F EM 870 A U 1-184 PDB
4V7R X-ray 400 A BQ/DQ 1-184 PDB
4V88 X-ray 300 A BP/DP 1-184 PDB
4V8T EM 810 A P 1-184 PDB
4V8Y EM 430 A BP 2-184 PDB
4V8Z EM 660 A BP 2-184 PDB
4V91 EM 370 A P 1-184 PDB
5APN EM 391 A P 1-184 PDB
5APO EM 341 A P 1-184 PDB
5DAT X-ray 315 A M7/m7 2-184 PDB
5DC3 X-ray 325 A M7/m7 2-184 PDB
5DGE X-ray 345 A M7/m7 2-184 PDB
5DGF X-ray 330 A M7/m7 2-184 PDB
5DGV X-ray 310 A M7/m7 2-184 PDB
5FCI X-ray 340 A M7/m7 2-184 PDB
5FCJ X-ray 310 A M7/m7 2-184 PDB
5GAK EM 388 A R 1-184 PDB
5H4P EM 307 A P 1-184 PDB
5I4L X-ray 310 A M7/m7 2-184 PDB
5JCS EM 950 A P 1-184 PDB
5JUO EM 400 A U 1-184 PDB
5JUP EM 350 A U 1-184 PDB
5JUS EM 420 A U 1-184 PDB
5JUT EM 400 A U 1-184 PDB
5JUU EM 400 A U 1-184 PDB
5LYB X-ray 325 A M7/m7 2-184 PDB
5M1J EM 330 A P5 2-184 PDB
5MC6 EM 380 A AX 1-184 PDB
5MEI X-ray 350 A CR/x 2-184 PDB
5NDG X-ray 370 A M7/m7 1-184 PDB
5NDV X-ray 330 A M7/m7 1-184 PDB
5NDW X-ray 370 A M7/m7 1-184 PDB
5OBM X-ray 340 A M7/m7 1-184 PDB
5ON6 X-ray 310 A CR/x 2-184 PDB
5T62 EM 330 A c 1-184 PDB
5T6R EM 450 A c 1-184 PDB
5TBW X-ray 300 A CR/x 2-184 PDB
5TGA X-ray 330 A M7/m7 2-184 PDB
5TGM X-ray 350 A M7/m7 2-184 PDB
5Z3G EM 365 A T 1-184 PDB
6C0F EM 370 A P 1-184 PDB
6CB1 EM 460 A P 1-184 PDB
6ELZ EM 330 A P 1-184 PDB
6EM1 EM 360 A P 1-184 PDB
6EM3 EM 320 A P 1-184 PDB
6EM4 EM 410 A P 1-184 PDB
6EM5 EM 430 A P 1-184 PDB
6FT6 EM 390 A P 1-184 PDB
6GQ1 EM 440 A P 2-184 PDB
6GQB EM 390 A P 2-184 PDB
6GQV EM 400 A P 2-184 PDB
6HD7 EM 340 A R 1-184 PDB
6HHQ X-ray 310 A CR/x 1-184 PDB
6I7O EM 530 A AX/XX 1-184 PDB
6M62 EM 320 A P 1-184 PDB
6N8J EM 350 A P 1-184 PDB
6N8K EM 360 A P 1-184 PDB
6N8L EM 360 A P 1-184 PDB
6N8M EM 350 A c 1-184 PDB
6N8N EM 380 A c 1-184 PDB
6N8O EM 350 A c 1-184 PDB
6OIG EM 380 A P 2-184 PDB
6Q8Y EM 310 A AX 2-184 PDB
6QIK EM 310 A U 2-155 PDB
6QT0 EM 340 A U 1-184 PDB
6QTZ EM 350 A U 1-184 PDB
6R84 EM 360 A 5 2-184 PDB
6R86 EM 340 A 5 2-184 PDB
6R87 EM 340 A 5 2-184 PDB
6RI5 EM 330 A U 1-184 PDB
6RZZ EM 320 A U 1-184 PDB
6S05 EM 390 A U 1-184 PDB
6S47 EM 328 A AR 2-184 PDB
6SNT EM 280 A v 1-184 PDB
6SV4 EM 330 A AX/XX/zX 1-184 PDB
6T4Q EM 260 A LP 2-184 PDB
6T7I EM 320 A LP 1-184 PDB
6T7T EM 310 A LP 1-184 PDB
6T83 EM 400 A A/Py 1-184 PDB
6TB3 EM 280 A AX 2-184 PDB
6TNU EM 310 A AX 2-184 PDB
6WOO EM 290 A P 3-182 PDB
6XIQ EM 420 A P 1-184 PDB
6XIR EM 320 A P 1-184 PDB
6YLG EM 300 A P 1-184 PDB
6YLH EM 310 A P 1-184 PDB
6YLX EM 390 A P 1-184 PDB
6YLY EM 380 A P 1-184 PDB
6Z6J EM 340 A LP 1-184 PDB
6Z6K EM 340 A LP 1-184 PDB
7AZY EM 288 A y 1-184 PDB
7B7D EM 330 A LR 2-184 PDB
7BT6 EM 312 A P 1-184 PDB
7BTB EM 322 A P 1-184 PDB
7MPI EM 305 A AP 2-184 PDB
7MPJ EM 270 A AP 2-184 PDB
7N8B EM 305 A AP 2-184 PDB
7NAC EM 304 A P 1-184 PDB
7NAD EM 304 A P 1-184 PDB
7NRC EM 390 A LR 2-184 PDB
7NRD EM 436 A LR 2-184 PDB
7OF1 EM 310 A P 1-184 PDB
7OH3 EM 340 A P 1-184 PDB
7OHP EM 390 A P 1-184 PDB
7OHQ EM 310 A P 1-184 PDB
7OHR EM 472 A P 1-184 PDB
7OHS EM 438 A P 1-184 PDB
7OHU EM 370 A P 1-184 PDB
7OHV EM 390 A P 1-184 PDB
7OHW EM 350 A P 1-184 PDB
7OHX EM 330 A P 1-184 PDB
7OHY EM 390 A P 1-184 PDB
7R72 EM 307 A P 1-184 PDB
7R7A EM 304 A P 1-184 PDB
7TOO EM 270 A AL17 1-184 PDB
7TOP EM 240 A AL17 1-184 PDB
7U0H EM 276 A P 1-184 PDB
7UG6 EM 290 A P 1-184 PDB
7UOO EM 234 A P 1-184 PDB
7UQB EM 243 A P 1-184 PDB
7UQZ EM 244 A P 2-184 PDB
7V08 EM 236 A P 1-184 PDB
7Z34 EM 380 A P 1-184 PDB
7ZPQ EM 347 A BO 2-184 PDB
7ZRS EM 480 A BO 2-184 PDB
7ZS5 EM 320 A BQ 2-184 PDB
7ZUW EM 430 A BO 2-184 PDB
7ZUX EM 250 A EO 2-184 PDB
7ZW0 EM 240 A LS 1-184 PDB
8AAF EM 250 A C 1-184 PDB
8AGT EM 260 A C 1-184 PDB
8AGU EM 270 A C 1-184 PDB
8AGV EM 260 A C 1-184 PDB
8AGW EM 260 A C 1-184 PDB
8AGX EM 240 A C 1-184 PDB
8AGZ EM 260 A C 1-184 PDB
8BIP EM 310 A LP 2-184 PDB
8BJQ EM 380 A LP 2-184 PDB
8BN3 EM 240 A M7 2-184 PDB
8BQD EM 390 A AX 2-184 PDB
8BQX EM 380 A AX 2-184 PDB
8CCS EM 197 A B 1-184 PDB
8CDL EM 272 A B 1-184 PDB
8CDR EM 204 A B 1-184 PDB
8CEH EM 205 A B 1-184 PDB
8CF5 EM 271 A B 1-184 PDB
8CG8 EM 257 A B 1-184 PDB
8CIV EM 247 A B 1-184 PDB
8CKU EM 311 A B 1-184 PDB
8CMJ EM 379 A B 1-184 PDB
8EUB EM 252 A AP 1-184 PDB
8EVP EM 238 A AP 1-184 PDB
8EVQ EM 272 A AP 1-184 PDB
8EVR EM 287 A AP 1-184 PDB
8EVS EM 262 A AP 1-184 PDB
8EVT EM 220 A AP 1-184 PDB
8EWB EM 287 A AP 1-184 PDB
8EWC EM 245 A AP 1-184 PDB
8HFR EM 264 A Pv 1-184 PDB
8Y0U EM 359 A LP 1-184 PDB
AF-P05740-F1 Predicted AlphaFoldDB

2 variants for P05740

Variant ID(s) Position Change Description Diseaes Association Provenance
s11-109322 17 A>S No SGRP
s11-109430 53 D>N No SGRP

No associated diseases with P05740

1 regional properties for P05740

Type Name Position InterPro Accession
conserved_site Ribosomal protein L27, conserved site 84 - 98 IPR018261

Functions

Description
EC Number
Subcellular Localization
  • Cytoplasm
PANTHER Family
PANTHER Subfamily
PANTHER Protein Class
PANTHER Pathway Category No pathway information available

4 GO annotations of cellular component

Name Definition
cytoplasm The contents of a cell excluding the plasma membrane and nucleus, but including other subcellular structures.
cytosol The part of the cytoplasm that does not contain organelles but which does contain other particulate matter, such as protein complexes.
cytosolic large ribosomal subunit The large subunit of a ribosome located in the cytosol.
preribosome, large subunit precursor A preribosomal complex consisting of 27SA, 27SB, and/or 7S pre-rRNA, 5S rRNA, ribosomal proteins including late-associating large subunit proteins, and associated proteins; a precursor of the eukaryotic cytoplasmic large ribosomal subunit.

1 GO annotations of molecular function

Name Definition
structural constituent of ribosome The action of a molecule that contributes to the structural integrity of the ribosome.

2 GO annotations of biological process

Name Definition
cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) Endonucleolytic cleavage within ITS2 between the 5.8S rRNA and the LSU-rRNA of an rRNA molecule originally produced as a tricistronic rRNA transcript that contained the Small SubUnit (SSU) rRNA, the 5.8S rRNA, and the Large SubUnit (LSU) rRNA, in that order, from 5' to 3' along the primary transcript.
cytoplasmic translation The chemical reactions and pathways resulting in the formation of a protein in the cytoplasm. This is a ribosome-mediated process in which the information in messenger RNA (mRNA) is used to specify the sequence of amino acids in the protein.

8 homologous proteins in AiPD

UniProt AC Gene Name Protein Name Species Evidence Code
P46990 RPL17B 60S ribosomal protein L17-B Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) PR
Q3T025 RPL17 60S ribosomal protein L17 Bos taurus (Bovine) PR
Q5XTY7 RPL17 60S ribosomal protein L17 Felis catus (Cat) (Felis silvestris catus) PR
Q9W3W8 RpL17 60S ribosomal protein L17 Drosophila melanogaster (Fruit fly) PR
P18621 RPL17 60S ribosomal protein L17 Homo sapiens (Human) PR
P24049 Rpl17 60S ribosomal protein L17 Rattus norvegicus (Rat) PR
Q93VI3 RPL17A 60S ribosomal protein L17-1 Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) PR
P51413 RPL17B 60S ribosomal protein L17-2 Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) PR
10 20 30 40 50 60
MARYGATSTN PAKSASARGS YLRVSFKNTR ETAQAINGWE LTKAQKYLEQ VLDHQRAIPF
70 80 90 100 110 120
RRFNSSIGRT AQGKEFGVTK ARWPAKSVKF VQGLLQNAAA NAEAKGLDAT KLYVSHIQVN
130 140 150 160 170 180
QAPKQRRRTY RAHGRINKYE SSPSHIELVV TEKEEAVAKA AEKKVVRLTS RQRGRIAAQK
RIAA